L'acquario, considerato tra i più completi mediterranei, è una struttura completamente privata, che non può essere paragonata per dimensioni ed investimenti a quelli di Genova o Cattolica. All'interno dei suoi 1000 metri quadri di superficie sono presenti un centinaio di acquari allestiti con materiali naturali ed artificiali in modo da riprodurre nella maniera più fedele possibile i vari habitat naturali in cui vivono le oltre 150 differenti specie di organismi marini mediterranei esposte. L'Acquario dell'Elba è costantemente impegnato sul fronte della conservazione e dell'educazione ambientale, collaborando con il corpo Forestale, la Capitaneria di Porto e varie associazioni ambientalistiche per il recupero e la protezione delle tartarughe marine. L'acquario dispone inoltre di una vasca dove è possibile ammirare tre specie di squali il pinna bianca del reef, lo squalo nutrice e lo squalo tappeto maculato.